Народный суд в Бай-Тайгинском кожууне был создан после того как, в конце апреля – начале мая 1945 года был образован отдел внутренних дел.

В 1962-1963 гг. районные суды Бай-Тайгинского, Монгун-Тайгинского кожуунов были присоединены к Барун-Хемчикскому суду. Однако спустя два года Бай-Тайгинский районный суд снова приобрел самостоятельный статус.