Зеленогорский городской суд был образован в 1956 году. В самом начале Зеленогорский городской суд имел называние спец.Суд.

14 августа 1956 года приказом Второго Управления г. Москва в городе Красноярске – 45 основан спец.Суд № 81, председателем назначен Мишенин Иван Тимофеевич.
Через некоторое время произошло переименование, суд стал называться  - Третья постоянная сессия Красноярского краевого суда.
До  1993 года к подсудности спец.Суда №81 были отнесены  дела, которые ныне подсудны мировому судье, военным судам и иным специализированным судам. Большое количество уголовных дел рассматривалось в выездных судебных заседаниях, в основном это были дела военнослужащих.

Немногим позже, 03 марта 1993, произошло очередное переименование - Третья постоянная сессия Красноярского краевого суда была переименована в Красноярск – 45 городской народный суд.
К середине 90-х годов город Красноярск – 45 получил новое название – Зеленогорск. Новое «имя» города повлекло смену наименования суда. С тех пор и до настоящего времени в Зеленогорске функционирует Зеленогорский городской суд Красноярского края.

Первым председателем был Мишенин Иван Тимофеевич. В то время суд был односоставным: председатель, секретарь - Смирнова Неля Михайловна, заведующая канцелярией – Александрова Екатерина Алексеевна, судебный исполнитель – Милова Зоя Александровна. Немногим позже была добавлена ставка судьи, её заняла Кушнарёва Маргарита Васильевна.

Вторым председателем был Крюков Фёдор Иванович.
Третий председатель суда -  Першин Владимир Харитонович.
Четвёртым председателем был назначен Кушлак Виктор Дмитриевич.
Пятый председатель суда – Воробович Владимир Иванович.
Шестым председателем был Коновалов Михаил Ильич.
С 2002 года по настоящее время председателем Зеленогорского городского суда Красноярского края является Еромасов Александр Владимирович.

В результате изменения Российского законодательства, касающегося судебной системы, в г. Зеленогорске образованы судебные участки №№ 30,31,136 и назначены мировые судьи.

Наряду с увеличением численности населения города Зеленогорска, увеличилось и количество рассматриваемых судом  уголовных, административных и гражданских дел.
В связи с таким положением количество ставок федеральных судей увеличилось до 6 составов суда. В недалёком прошлом добавилась ещё одна ставка судьи, и суд стал 7 составным.

Сегодня в Зеленогорском федеральном городском суде работают 7 судей: Бойцова Лариса Анатольевна, Жуков Константин Михайлович, Аюпов Юрий Шамильевич, Овчинников Павел Александрович, Марковкина Наталья Анатольевна, Тюрина Наталья Ивановна, во главе с председателем Еромасовым Александром Владимировичем.

Мировыми судьями назначены: Доронин Станислав Валерьевич и Моисеенкова Ольга Леонидовна, Новикова Виктория Владимировна.

С сентября 2009 года Зеленогорский городской суд располагается в новом двухэтажном здании по улице Бортникова, 24.