На основании решения оргкомитета ВЦИК по Алтайскому краю от 3 июня 1939 года было образовано Управление Наркомата юстиции РСФСР по Алтайскому краю, в подчинение которого вошел народный суд Панкрушихинского района.

На основании Закона РФ № 7 от 08.01.98 г. "О Судебном департаменте при Верховном Суде Российской Федерации, распоряжением администрации края "Об образовании Управления Судебного департамента при Верховном Суде РФ" от 04.08.98 г. суды в Алтайском крае, в том числе и Панкрушихинский районный суд, переданы в подчинение Судебного департамента при Верховном Суде РФ в Алтайском крае.