23 июня 1923 года была образована Арбитражная комиссия при Удмуртском облисполкоме. Деятельность комиссии была направлена на разрешение имущественных споров между государственными учреждениями и предприятиями области, на повышение хозяйственной дисциплины и ответственности организаций.

Комиссия была упразднена 3 мая 1931 года и передала свои функции вновь образованному Государственному арбитражу при Удмуртском облисполкоме. Государственный арбитраж учреждался для разрешения наиболее крупных и важных хозяйственных споров между государственными, кооперативными (кроме колхозов) и другими общественными предприятиями, организациями и учреждениями, входящими в систему разных ведомств, для укрепления плановой и договорной дисциплины, хозяйственного расчета, повышения материальной ответственности хозяйственных органов.

3 декабря 1960 было утверждено новое Положение о Государственном арбитраже, согласно которому были расширены права. Еще значительнее расширились полномочия госарбитражей в связи с принятием Закона "О Государственном арбитраже в СССР" от 30 ноября 1979 года.

В связи с принятием Закона РСФСР от 4 июля 1991 года "Об арбитражном суде" Верховный Совет Удмуртской Республики 4 февраля 1992 года принял Закон Удмуртской Республики "Об учреждении Высшего арбитражного суда Удмуртской Республики..." Председателем Высшего арбитражного суда Удмуртской Республики избран бывший Главный государственный арбитр Бойко Василий Степанович. 5 апреля 1995 года Высший арбитражный суд Удмуртской Республики переименован в Арбитражный суд Удмуртской Республики.

В 2005 году исполняющим обязанности Председателя назначен председатель гражданской коллегии Зинатуллин Марсель Миннухович. В 2006 году Указом Президента РФ № 1129 от 12 октября 2006 года председателем Арбитражного суда УР назначен Ермолин Алексей Леонидович.