Баяндаевский районный суд как самостоятельное государственное учреждение был образован и начал работу 23 апреля 1976 года. Первым председателем Баяндаевского районного суда был Григорий Болдохонович Болдохонов.

За время работы судьями Баяндаевского районного суда было рассмотрено большое количество уголовных, гражданских и административных дел.

В советский период подсудность Баяндаевского районного суда распространялась  на территорию Баяндаевского района: 11 сельских Советов, 17 населенных пунктов с населением более 14 тыс.человек. На 1 января 1989 г. в суде работал 1 народный судья и 70 заседателей.

На сегодняшний день юрисдикция  Баяндаевского районного суда  распространяется на территорию Баяндаевского района Иркутской области, в состав которого входят 12 муниципальных образований. Суд четырехсоставный.