Первые упоминания  о Богучарском уездном суде в исторических справках датируются 1773-им годом. До Октябрьской социалистической революции 1917 года в Богучарском уезде было три стана (Калач, Петропавловка, Михайловка) и несколько десятков урядничих участков. Отправление правосудия в станах, наряду с уездным судом, осуществлял земский суд.

С 1935 года Богучарский район входил в состав Радченского района Воронежской области, а в 1954 году Богучарский и Радченский районы вошли в состав Каменской области. С 19 ноября 1957 года Богучарский район вновь вошел в состав Воронежской области. Окончательно границы района сложились 19 декабря 1970 года,  после отсоединения Верхнемамонского района. Вновь образованному Верхнемамонскому районному суду были переданы дела отошедших району сельских Советов, рассмотренные до 1970 года.

Мировая юстиция, существовавшая в Богучарском уезде до 1917 года, возродилась в районе в 2001 году. Было создано два судебных мировых участка, состоящие из населения города Богучара (участок № 1), и населения, проживающего в сельской местности Богучарского района (участок № 2).