За время существования Большечерниговского районного суда Самарской области его дважды объединяли с Большеглушицким районным судом Куйбышевской области - в 1935 и 1961 годах. В соответствии с постановлением ВЦИК от 25 января 1935 года о новой сети районов Средне-Волжского края было образовано 14 новых районов, в том числе Большечерниговский район. Во вновь образованных районах были созданы судебные участки и открыты районные суды.

В списке судебных учреждений Куйбышевского края на 1 мая 1935 года значится Большечерниговский районный народный суд, располагавшийся в селе Большая Черниговка.

Решением №52 Куйбышевского облисполкома от 16 января 1965 года вновь был образован Большечерниговский район в составе Куйбышевской области. Большечерниговская постоянная сессия Большеглушицкого народного суда Куйбышевской области была преобразована в Большечерниговский народный суд.

До 25 января 1991 года название суда не менялось и назывался Большечерниговский районный народный суд Куйбышевской области.
На основании Указа Президиума Верховного Совета РСФСР от 25 января 1991 года № 521-1 Куйбышевская область переименована в Самарскую область и в связи с этим изменено название на Большечерниговский народный суд Самарской области.
В соответствии с Законом РФ «О судебной системы» Российской Федерации от 31 декабря 1996 года (ст.21) районные суды с 1 января 1997 года стали называться федеральными судами общей юрисдикции.

Согласно письму Судебного Департамента при Верховном суде РФ от 25 декабря 1998 года № СД-4/1062 суд Большечерниговского района получил название Большечерниговский районный суд Самарской области. По вопросам материально-технического обеспечения, финансирования, кадров Большечерниговский районный суд находится в подчинении Управления Судебного Департамента РФ в Самарской области.