Впервые суд Благовещенского района был образован в 1941 году (более точная дата не установлена). В 1962 году был упразднён Благовещенский район и в марте 1963 года расформирован Благовещенский районный суд.

В 1967 году были вновь образованы Благовещенский район и 14 февраля 1967 года решением  Исполнительного Комитета  Амурского областного Совета депутатов трудящихся № 75 – Благовещенский районный суд.
С 1941 по 1963 годы о месте нахождения здания  суда архивные данные не сохранились.

С 1967 года по 1971 годы деревянное здание суда располагалось по адресу: г.Благовещенск, ул. Амурская, 182-А, которое впоследствии  сгорело в 90-ые годы прошлого столетия.

С 1971 по 1993 годы суд Благовещенского района размещался в здании по ул. Пионерской, 35. Поскольку, в этом здании находились Управление юстиции Амурской области, Благовещенский городской суд, то для районного суда  был выделен один рабочий кабинет, в котором и размещался аппарат суда вместе с судьёй.

В 1993 году Благовещенскому районному суду было передано в аренду бывшее здание райкома партии, расположенное по адресу: ул. 50 лет Октября, 1, где районный суд размещался  до 2003 года.

С июня 2003 года  Благовещенский районный суд располагается в здании по адресу: ул. Октябрьская, 88, находящемся в оперативном управлении Управления Судебного департамента в Амурской области.

С 1941 по 1991 годы правосудие в районном суде отправляли народные судьи, по штату – 1 ед. В 1991 году,  помимо судьи, вводится должность председателя суда.